MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC2

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018698	CTT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018698	AT	3	6	44	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018698	TGGC	2	8	148	155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018698	T	7	7	238	244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018698	CAACA	2	10	320	329	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018698	TTA	4	12	347	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018698	T	7	7	366	372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018698	AAG	2	6	408	413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018698	CAAG	2	8	423	430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018698	TTGA	2	8	441	448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018698	GAA	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018698	GAA	2	6	495	500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018698	A	7	7	499	505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018698	CAAA	2	8	513	520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018698	GTC	2	6	539	544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018698	A	7	7	615	621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018698	TATT	2	8	647	654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018698	CTA	2	6	740	745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018698	TTGT	2	8	761	768	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018698	AGT	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018698	T	6	6	822	827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018698	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018698	TGT	2	6	966	971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018698	ATA	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018698	CAAA	2	8	991	998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018698	ATGT	2	8	1003	1010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018698	TGG	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018698	CTTTT	2	10	1039	1048	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018698	T	6	6	1053	1058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018698	ATA	2	6	1074	1079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018698	CAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018698	TA	5	10	1150	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018698	AT	3	6	1271	1276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018698	TA	4	8	1278	1285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018698	TA	3	6	1312	1317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018698	TA	3	6	1320	1325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018698	T	7	7	1329	1335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018698	A	6	6	2567	2572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018698	GCA	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018698	AGC	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018698	GGT	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018698	AGT	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018698	TCT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018698	T	6	6	2932	2937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018698	CAT	2	6	2938	2943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018698	A	8	8	2960	2967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018698	AAAT	2	8	2987	2994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018698	TCC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018698	AAT	2	6	3526	3531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018698	AAT	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018698	CAC	2	6	3589	3594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018698	TAAAA	2	10	3646	3655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018698	A	6	6	6098	6103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018698	TAAAT	2	10	6150	6159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018698	TAT	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018698	TCAAA	2	10	6188	6197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018698	TA	3	6	6204	6209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018698	A	7	7	6265	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018698	T	6	6	6277	6282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018698	A	6	6	6289	6294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018698	AT	3	6	6298	6303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018698	A	7	7	6333	6339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018698	ATC	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018698	CTT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018698	CTCA	2	8	6450	6457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018698	ATT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018698	A	6	6	6535	6540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018698	ATT	2	6	6554	6559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018698	TGTAAT	2	12	6562	6573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018698	ACA	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018698	TA	3	6	8232	8237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018698	TGTA	2	8	8281	8288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018698	ATATTT	2	12	9140	9151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018698	AAT	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018698	ATC	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018698	TAC	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018698	TCAGT	2	10	9283	9292	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018698	CAAA	2	8	9328	9335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018698	T	7	7	9361	9367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018698	TAAA	2	8	9652	9659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018698	GAAATA	2	12	9679	9690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018698	TATAA	2	10	9714	9723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018698	GTT	2	6	9791	9796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018698	TAA	2	6	9804	9809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018698	T	6	6	9875	9880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018698	TAG	2	6	9899	9904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018698	ACT	2	6	9909	9914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018698	AAC	2	6	9926	9931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018698	CAA	2	6	10006	10011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018698	CCA	2	6	10038	10043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018698	CTTG	2	8	10052	10059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018698	TAAA	2	8	10060	10067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018698	A	7	7	10092	10098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018698	TTA	2	6	10115	10120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018698	AGT	2	6	10137	10142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018698	TA	3	6	10177	10182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018698	ATTAA	2	10	10787	10796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018698	AT	3	6	10836	10841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018698	TCAGT	2	10	10846	10855	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018698	TAT	2	6	10890	10895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018698	CTT	2	6	10947	10952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018698	A	6	6	11274	11279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018698	CTA	2	6	12148	12153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018698	GAG	2	6	12169	12174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018698	AAT	2	6	12192	12197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018698	A	7	7	12237	12243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018698	TTTA	2	8	12281	12288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018698	CCT	2	6	12841	12846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018698	CCT	2	6	13442	13447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018698	TAA	2	6	13458	13463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018698	TTA	2	6	13464	13469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018698	A	7	7	13755	13761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018698	TGA	2	6	13837	13842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018698	GCATT	2	10	13845	13854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018698	AAATTA	2	12	13884	13895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018698	GGT	2	6	13898	13903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018698	A	7	7	14327	14333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018698	AATT	2	8	14363	14370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018698	CACT	2	8	14428	14435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018698	TA	3	6	14465	14470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018698	GTT	2	6	14530	14535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018698	T	7	7	14534	14540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018698	ATA	2	6	14551	14556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018698	ATG	2	6	16252	16257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018698	T	6	6	16268	16273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018698	AAT	2	6	16321	16326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018698	TCAT	2	8	16330	16337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018698	TAT	2	6	16374	16379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018698	ACA	2	6	17080	17085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018698	GTTT	2	8	17207	17214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018698	TGA	2	6	17329	17334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018698	A	6	6	17440	17445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018698	T	6	6	17449	17454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018698	CAG	2	6	17457	17462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018698	ATT	2	6	17611	17616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018698	CTG	2	6	17657	17662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018698	AGA	2	6	17682	17687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018698	AAT	2	6	17716	17721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018698	T	7	7	17784	17790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018698	TC	3	6	18294	18299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018698	GTG	2	6	18301	18306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018698	AT	3	6	18316	18321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018698	A	6	6	18325	18330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018698	ATT	2	6	18398	18403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018698	T	6	6	18492	18497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018698	T	6	6	18508	18513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018698	CCAG	2	8	18536	18543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018698	T	8	8	18553	18560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018698	GTT	2	6	18573	18578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018698	GC	3	6	18815	18820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018698	TTG	2	6	18822	18827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018698	AAT	2	6	18884	18889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018698	CGC	2	6	18899	18904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_018698	TCA	2	6	18981	18986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018698	TCC	2	6	19724	19729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_018698	TAAA	2	8	20537	20544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018698	TA	3	6	20546	20551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018698	TAG	2	6	22720	22725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018698	ATG	2	6	22777	22782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018698	ATA	2	6	22808	22813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018698	ATC	2	6	22839	22844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_018698	ATT	2	6	22856	22861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018698	AAAC	2	8	22896	22903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_018698	AT	3	6	22917	22922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018698	CGA	2	6	22979	22984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_018698	TTTTA	2	10	22987	22996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018698	A	7	7	22998	23004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018698	TTG	2	6	23208	23213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018698	AAT	2	6	23222	23227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018698	TCT	2	6	23230	23235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_018698	TGTT	2	8	23261	23268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018698	TCA	2	6	23281	23286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_018698	CAAA	2	8	23339	23346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_018698	TG	3	6	23378	23383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018698	CA	3	6	23386	23391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_018698	CAA	2	6	23403	23408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_018698	AC	3	6	23452	23457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
178	NC_018698	TGG	2	6	23488	23493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018698	A	6	6	23515	23520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018698	ATT	2	6	23596	23601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018698	TTA	2	6	23606	23611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018698	ACA	2	6	23641	23646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_018698	AAAG	2	8	23846	23853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018698	TAA	2	6	23892	23897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018698	CTAT	2	8	23914	23921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_018698	TGA	2	6	23929	23934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018698	A	7	7	23937	23943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018698	ATA	2	6	23947	23952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018698	ATT	2	6	23962	23967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_018698	TTCTC	2	10	24024	24033	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
191	NC_018698	TCA	2	6	24049	24054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_018698	ATT	2	6	24055	24060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_018698	TC	3	6	24072	24077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
194	NC_018698	A	8	8	24078	24085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018698	T	6	6	24106	24111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018698	ATA	2	6	24155	24160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_018698	A	6	6	24561	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018698	ATT	2	6	24607	24612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_018698	A	6	6	24618	24623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_018698	ATT	2	6	24653	24658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_018698	A	6	6	24680	24685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_018698	AAT	2	6	27141	27146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_018698	AAT	2	6	27182	27187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_018698	ATTA	2	8	28475	28482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_018698	A	8	8	28494	28501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_018698	A	7	7	28516	28522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_018698	AT	3	6	29603	29608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.